Dans la filière équine, la génomique s’applique à plusieurs niveaux. L’étude du génome équin permet de découvrir de plus en plus de gènes d’intérêt, qu’ils soient liés à des maladies, à la performance sportive, et bien d’autres. L’aptitude sportive est un caractère abordé par la mesure de plusieurs critères : le modèle, les allures et les performances en compétition observables sur le long terme. La génomique, en évaluant directement les allèles transmis par les parents, permet d’obtenir une caractérisation dès la naissance du poulain et de faciliter la détection précoce des « talents ».