Dans la filière équine, la génomique s’applique à plusieurs niveaux. L’étude du génome équin permet de découvrir de plus en plus de gènes d’intérêt, qu’ils soient liés à des maladies, à la performance sportive, et bien d’autres. L’aptitude sportive est un caractère abordé par la mesure de plusieurs critères : le modèle, les allures et les performances en compétition observables sur le long terme.